公司单位地址和职工的工作地点不在同一个城市,申请劳动仲裁时可以在合同履行地也就是工作的城市申请仲裁，也可以在企业的营业执照所在地申请仲裁，根据自己的方便去选择就近的城市去申请劳动仲裁。

法律依据：《中华人民共和国仲裁调解法》第二十一条 劳动争议仲裁委员会负责管辖本区域内发生的劳动争议。劳动争议由劳动合同履行地或者用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会管辖。双方当事人分别向劳动合同履行地和用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁的，由劳动合同履行地的劳动争议仲裁委员会管辖。